| Verze | 1.0 |
|---|---|
| Vydavatel | Armin Topfer |
| Datum vydání | 6. 5. 2013 |
| Datum přidáno | 6. 5. 2013 |
| Os požadavky | Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Požadavky | Java |
| Celkový počet stažení | 30 |
| Cena | Free |
Popis
QuasiRecomb je odlehčená aplikace, která běží v příkazové konzoli a simuluje Markovův model pro generování virových Quasispecies. Popisuje generování virových kvazidruhů a metodu pro odvození jeho parametrů analýzou sekvenačních dat další generace. Model je validován na simulovaných datech, což ukazuje výhodu explicitního zohlednění procesu rekombinace, a testován aplikací na hodnoty získané z experimentálních vzorků HIV. Nabízí implementaci EM algoritmu pro nalezení maximálních a posteriori odhadů parametrů modelu a metodu pro odhad distribuce virových kmenů v kvazidruhech.
