MultiGeneBlast
| Verze | 1.1.5 |
|---|---|
| Vydavatel | MultiGeneBlast |
| Datum vydání | 3. 4. 2013 |
| Datum přidáno | 4. 4. 2013 |
| Os požadavky | Windows 2003, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Požadavky | None |
| Celkový počet stažení | 95 |
| Cena | Free |
Popis
MultiGeneBlast je nástroj s otevřeným zdrojovým kódem založený na přeformátování hlaviček FASTA proteinových záznamů NCBI GenBank, pomocí kterého může sledovat jejich zdrojový nukleotid a souřadnice. MultiGeneBlast může pomoci při detekci takových multigenových částí pro projekty syntetické biologie. Syntetická knihovna operonů může být vytvořena na základě jejího výstupu k identifikaci těch operonů, jejichž funkce je nejbližší té, kterou požaduje uživatel. Tento nástroj poskytuje příležitosti k identifikaci všech homologních genomových oblastí kombinací výsledků jednotlivých běhů BlastP na každém genu a tříděním genomových oblastí z libovolné položky GenBank podle počtu zásahů, zachování syntenie a kumulativního skóre bitů Blast. Prohledávání architektury lze provádět za účelem nalezení jakýchkoli genomických oblastí s Blast zásahy do jakékoli uživatelem specifikované kombinace aminokyselinových sekvencí.
