RightField

Popis

RightField může specifikovat rozsah povolených termínů z vybrané ontologie (podtřídy, jednotlivci nebo kombinace) pro každé pole anotace. Výsledná tabulka představuje tyto pojmy uživatelům jako jednoduchý rozevírací seznam. To snižuje bariéru přijetí pro používání komunitních ontologií, protože anotace je vytvořena vědcem, který generoval data, nikoli třetí stranou, a anotace je shromažďována v době sběru dat.

RightField je samostatná Java aplikace, která používá Apache-POI pro interakci s dokumenty společnosti Microsoft. Umožňuje uživatelům importovat tabulky aplikace Excel nebo vytvářet nové úplně od začátku. Ontologie mohou být importovány buď z jejich lokálních souborových systémů, nebo z úložiště ontologie BioPortal. Jednotlivé buňky nebo celé sloupce nebo řádky mohou být označeny požadovanými rozsahy termínů ontologie a jednotlivá tabulka může být anotována termíny z více ontologií.

Po označení a uložení obsahuje tabulka s podporou RightField „skryté“ listy s informacemi o původu a verzích ontologií použitých v anotaci. Tyto informace o původu jsou důležité v případě budoucích změn ontologie, které mohou znehodnotit již zvolené hodnoty nebo mohou přidat jemnější možnosti a urychlit novou anotaci. RightField je určen jako nástroj správce. Rozšiřuje tabulky, které již mohou odpovídat konkrétním šablonám, aby se dále standardizovala terminologie.