Protein Player for Android APK

Popis

Tato aplikace umožňuje uživatelům poslouchat vibrace v molekulách bílkovin, které představují základní stavební kameny života. Metoda, jak učinit nanoskopické vibrace proteinů slyšitelnými, je založena na algoritmu pro automatický výpočet vibračních spekter více než 100 000 proteinů dostupných v Protein Data Bank [1]. Výsledná frekvenční spektra proteinů pak použijeme k vytvoření slyšitelnosti pomocí hudebně teoretického konceptu transpoziční ekvivalence. Při tomto procesu jsou vibrace slyšitelné ve frekvenčním rozsahu dostupném lidskému uchu, přičemž relativní hodnoty vibrací jsou zachovány. Tento algoritmus reprodukuje charakteristické zvuky jednotlivých proteinových molekul a umožňuje hráčům používat proteinové molekuly jako nový typ hudebního nástroje.

Různé obrazovky v této aplikaci umožňují přístup k různým sadám proteinů, které lze přehrávat dotykem tlačítek. Více o proteinech se můžete dozvědět v Protein Data Bank (PDB) https://www.rcsb.org/ (zadejte čtyřznakový kód do vyhledávacího pole a o každém z proteinů se dozvíte více).

První tři obrazovky umožňují přístup k řadě proteinů, kde se současně přehrávají vibrace spojené se všemi režimy. Poslední dvě obrazovky umožňují uživatelům hrát 64 individuálních režimů spojených s jedním proteinem s kódem Protein Data Bank 5iom (tento protein je nukleosiddifosfátkináza ze schistosoma mansoni, vodního parazita lidí).

Vibrační spektrum definované proteinem určuje nový druh hudební stupnice a ladění, které se skládá z jedinečných frekvencí spojených s proteinem.

Vědecká reference:

[1] Z. Qin, M. J. Buehler, Analýza vibračního a zvukového spektra více než 100 000 proteinových struktur a aplikace při sonifikaci, Extreme Mechanics Letters, sv. 29, str. 100460, 2019. DOI: https://doi.org/10.1016/j.eml.2019.100460

(c) 2019 Massachusetts Institute of Technology (MIT), kontakt: [email protected]

VAROVÁNÍ: Tato aplikace vytváří zvuky, které mohou poškodit váš sluch. Buďte prosím opatrní. Autoři nenesou odpovědnost ani neručí za případné škody.

Aplikace vyvinutá Eric L. Buehlerem, 20. dubna 2019, v1.01