| Verze | 2.1.2 |
|---|---|
| Vydavatel | BioSolveIT |
| Datum vydání | 2. 5. 2013 |
| Datum přidáno | 2. 5. 2013 |
| Os požadavky | Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Požadavky | None |
| Celkový počet stažení | 25 |
| Cena | Free |
Popis
FlexS předpovídá konformaci a orientaci jednoho z ligandů vzhledem k druhému. Ve FlexS se předpokládá, že referenční ligand je rigidní, proto by měl být podán v konformaci, která je podobná vázanému stavu. Algoritmus superpozice ve FlexS vyžaduje jen malý ruční zásah. Tyto znalosti můžete integrovat do výpočtů pomocí FlexS provedením jednotlivých kroků ručně. FlexS je tedy navržen pro interaktivní práci s ligandovými páry i pro virtuální screening na bázi ligandů. Dvě hlavní aplikace FlexS jsou superpolohování ligandu (např. pro CoMFA/QSAR) a virtuální screening. Pokud máte protein a malou molekulu, která se na něj váže (tzv. referenční ligand), ale žádnou strukturu proteinu, můžete referenční strukturu považovat za negativní otisk aktivního místa. FlexS určuje podobnost mezi testem a referenční strukturou jejich zarovnáním. Ve virtuálním screeningu máte referenční ligand a sadu sloučenin a máte zájem o stanovení priority sloučenin pro experimentální testování.
