| Verze | 7.3 |
|---|---|
| Vydavatel | Scalable Computing Laboratory |
| Datum vydání | 28. 5. 2009 |
| Datum přidáno | 28. 5. 2009 |
| Os požadavky | Mac OS X 10.3.9/10.4 Intel/10.4 PPC/10.5 Intel/10.5 PPC |
| Požadavky | None |
| Celkový počet stažení | 864 |
| Stahování za týden | 1 |
| Cena | Free |
Popis
MacMolPlt je nástroj pro vizualizaci chemie, který lze použít k vytváření molekul pomocí integrovaného tvůrce grafických modelů, vytváření vstupních souborů pro program výpočetní chemie GAMESS a poté k vizualizaci výsledků běhů výpočetní chemie. Mezi funkce patří vysoce kvalitní 3D zobrazení, animace normálních režimů a reakčních sekvencí a výstup do různých formátů včetně vysoce kvalitních obrázků a filmů ve formátu QuickTime a Flash.
Použití vstupu: Formát souboru MolPlt vyražený aplikací GAMESS vložením kartézských souřadnic z libovolného souboru protokolu GAMESS nebo Gaussian jakéhokoli vstupního souboru GAMESS, souboru protokolu nebo irc souboru Xmol ve stylu XYZ Soubory ve formátu MolDen Soubory Protein Data Bank (pdb) Soubor Chemical Markup Language (CML) soubory Vytvářejte graficky pomocí interaktivního editoru molekul Vytvářejte ručně pomocí vnitřních souřadnic kartézského stylu nebo stylu Z-Matrix 3D zobrazení struktury a Normální režim Animace normálních režimů. 3D rotace a posouvání v reálném čase pod kontrolou myši Výpočet libovolného parametru matice Z Vizuálně změřte/zobrazte vzdálenosti, úhly a vodorovné profily. Automatizované vytváření cest lineárního nejmenšího pohybu (LLM) 2D a 3D výpočet a zobrazení: Molekulárních orbitalů (AO, MO nebo LMO) Rozdílů v hustotě elektronů Molekulární elektrostatické potenciály (MEPMaps) Základní generátor vstupních souborů pro GAMESS OpenGL používaný pro vysoké kvalitní 3D vykreslování Podpora molekulární symetrie Generování atomů závislých na symetrii Určení jedinečných atomů symetrie Automaticky určit seznam podporovaných skupin bodů pro sadu souřadnic. Otočte souřadnice do správné základní orientace Zobrazení operátorů symetrie pro mnoho skupin bodů Výstup v kvalitě publikace (barevný nebo černobílý) prostřednictvím přímého tisku nebo kopírování a vkládání do jiné aplikace. Výstup v různých formách, včetně bitmap Windows, JPEG, PNG, CML, XMol XYZ, MDL molfile, POV-Ray, Flash Movies a QuickTime filmů.
