| Verze | 1.01 |
|---|---|
| Vydavatel | Paul A. Wilson |
| Datum vydání | 25. 8. 2008 |
| Datum přidáno | 22. 8. 2004 |
| Os požadavky | Macintosh, Mac OS X 10.3 |
| Požadavky | Mac OS X 10.3 |
| Celkový počet stažení | 20 |
| Cena | Free |
Popis
Nástroj příkazového řádku pro porovnávání datových souborů oddělených čárkami pomocí relativních rozdílů k určení nejpodobnějších konformací. Compsortall porovnává datové soubory pomocí relativního rozdílu, vypočítá skóre podobnosti, seřadí skóre mimo jádro ve vzestupném pořadí (nižší hodnoty představují větší podobnost), uloží všechna skóre do textového souboru. Datové soubory vytvořené uživatelem musí být textové soubory oddělené čárkami. Každý soubor představuje jedinečnou molekulu. Každý řádek v souboru představuje jedinečnou konformaci molekuly. První sloupec v datovém souboru musí být štítek jedinečný pro konformaci reprezentovanou řádkem. Zbývající sloupce jsou numerické deskriptory, například měření vzdálenosti. Řádky se porovnávají kombinatoricky mezi soubory. Porovnávané štítky jsou zřetězeny a uloženy se skóre pro sadu řádků. To poskytuje způsob, jak identifikovat konformace, které vytvořily dané skóre podobnosti.
Budoucí práce zahrnuje:
přidání GUI rozhraní
zveřejnění článku o mém 3D modelovacím algoritmu farmakoforu
Paralelní verze využívající MPI
