| Verze | 1.01 |
|---|---|
| Vydavatel | Paul A. Wilson |
| Datum vydání | 25. 8. 2008 |
| Datum přidáno | 11. 8. 2004 |
| Os požadavky | Macintosh, Mac OS X 10.3 |
| Požadavky | Mac OS X 10.3 |
| Celkový počet stažení | 29 |
| Cena | Free |
Popis
Nástroj příkazového řádku pro porovnávání datových souborů oddělených čárkami pomocí relativních rozdílů k určení nejpodobnějších konformací. Compsort porovnává datové soubory pomocí relativního rozdílu, vypočítá skóre podobnosti, seřadí skóre vzestupně (nižší hodnoty představují větší podobnost), uloží X počtu nízkých skóre.
Datové soubory vytvořené uživatelem musí být textové soubory oddělené čárkami. Každý soubor představuje jedinečnou molekulu. Každý řádek v souboru představuje jedinečnou konformaci molekuly. První sloupec v datovém souboru musí být štítek jedinečný pro konformaci reprezentovanou řádkem. Zbývající sloupce jsou numerické deskriptory, například měření vzdálenosti.
Řádky se porovnávají kombinatoricky mezi soubory. Porovnávané štítky jsou zřetězeny a uloženy se skóre pro sadu řádků. To poskytuje způsob, jak identifikovat konformace, které vytvořily dané skóre podobnosti.
Budoucí práce zahrnuje:
přidání GUI rozhraní
zveřejnění článku o mém 3D modelovacím algoritmu farmakoforu
Paralelní verze využívající MPI
